Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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