Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 RN7SL751P-201ENST00000473281 284 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC016629.2-201ENST00000597341 199 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC040162.2-201ENST00000573092 157 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 SLC4A4-203ENST00000351898 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 LDAH-209ENST00000440866 3728 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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