Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXQ1Q9C009 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms