Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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