Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PEX6Q13608 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149 ms