Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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CLN3Q13286 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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CLN3Q13286 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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CLN3Q13286 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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CLN3Q13286 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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