Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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