Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
MSMPQ1L6U9 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
MSMPQ1L6U9 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms