Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
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FOXD1Q16676 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
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FOXD1Q16676 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
FOXD1Q16676 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
FOXD1Q16676 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
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FOXD1Q16676 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
FOXD1Q16676 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
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FOXD1Q16676 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
FOXD1Q16676 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
FOXD1Q16676 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
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FOXD1Q16676 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
FOXD1Q16676 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
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