Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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ECM1Q16610 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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ECM1Q16610 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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ECM1Q16610 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ECM1Q16610 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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