Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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COL9A2Q14055 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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COL9A2Q14055 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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COL9A2Q14055 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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COL9A2Q14055 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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COL9A2Q14055 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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