Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms