Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms