Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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FOXQ1Q9C009 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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FOXQ1Q9C009 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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FOXQ1Q9C009 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXQ1Q9C009 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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