Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIN2CQ14957 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIN2CQ14957 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIN2CQ14957 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIN2CQ14957 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIN2CQ14957 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIN2CQ14957 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIN2CQ14957 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIN2CQ14957 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIN2CQ14957 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIN2CQ14957 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIN2CQ14957 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIN2CQ14957 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GRIN2CQ14957 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms