Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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