Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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