Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTN1Q16799 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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