Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NAE1Q13564 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms