Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 BMF-202ENST00000397573 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAK2-201ENST00000332624 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 UBAP2L-220ENST00000613315 3451 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ARID1B-232ENST00000637904 5913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 DGKG-202ENST00000344484 3445 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAMTS12-203ENST00000504830 8774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP7B-215ENST00000634844 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TTPAL-202ENST00000372904 6234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SRL-201ENST00000399609 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PRRC2B-202ENST00000357304 11042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO15A-201ENST00000205890 11863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PHC1-214ENST00000544916 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP2R2C-202ENST00000335585 4092 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 C18orf32-203ENST00000613385 5395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MYOM1-203ENST00000400569 4927 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NOLC1-202ENST00000405356 3967 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AL133492.1-201ENST00000617854 3955 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SENP3-EIF4A1-201ENST00000614237 3519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 DRP2-203ENST00000402866 7018 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RGMA-201ENST00000329082 11350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC064805.1-202ENST00000569279 3493 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007126.1-201ENST00000508202 4781 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC22A11-201ENST00000301891 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1S-202ENST00000367338 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 USP28-201ENST00000003302 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 GAGE2A-201ENST00000362097 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA80C-201ENST00000362917 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SWT1-201ENST00000367500 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP377-201ENST00000390852 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP376-201ENST00000390949 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SNRPGP11-201ENST00000411777 232 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AL831784.1-201ENST00000427302 373 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 LDAH-208ENST00000435420 3837 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL402P-201ENST00000465059 264 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL145P-201ENST00000469955 296 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL144P-201ENST00000475761 295 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SRSF5-204ENST00000553548 526 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM181A-AS1-201ENST00000554538 545 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE6G-202ENST00000571004 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 BOD1P1-201ENST00000584421 436 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AL596092.1-201ENST00000605701 304 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.208-201ENST00000629083 297 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AL645922.1-202ENST00000477310 3377 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ST5-237ENST00000530991 3396 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MET-201ENST00000318493 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ABT1-201ENST00000274849 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 POMGNT1-202ENST00000371992 2934 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SPTAN1-202ENST00000372731 7889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TMCC2-203ENST00000358024 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP6V0A1-202ENST00000343619 4128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 BTBD11-202ENST00000357167 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SLFN13-209ENST00000533791 4121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 UNC45A-216ENST00000639885 3255 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SCRN1-206ENST00000426154 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP188-201ENST00000372577 5689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TACC2-210ENST00000369005 9673 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 YPEL4-203ENST00000524669 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PUS7L-202ENST00000416848 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.3 ms