Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PKD2Q13563 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms