Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
RBM42Q9BTD8 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
RBM42Q9BTD8 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RBM42Q9BTD8 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
RBM42Q9BTD8 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RBM42Q9BTD8 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RBM42Q9BTD8 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RBM42Q9BTD8 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RBM42Q9BTD8 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RBM42Q9BTD8 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RBM42Q9BTD8 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RBM42Q9BTD8 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RBM42Q9BTD8 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RBM42Q9BTD8 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RBM42Q9BTD8 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RBM42Q9BTD8 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RBM42Q9BTD8 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RBM42Q9BTD8 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.1 ms