Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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LAMA4Q16363 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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LAMA4Q16363 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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LAMA4Q16363 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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LAMA4Q16363 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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LAMA4Q16363 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
LAMA4Q16363 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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