Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERFP50548 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERFP50548 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ERFP50548 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERFP50548 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ERFP50548 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERFP50548 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERFP50548 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERFP50548 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERFP50548 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERFP50548 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERFP50548 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERFP50548 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERFP50548 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERFP50548 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERFP50548 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.8 ms