Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF6Q9Y4K3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF6Q9Y4K3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF6Q9Y4K3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF6Q9Y4K3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF6Q9Y4K3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF6Q9Y4K3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms