Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDD3Q9Y3P4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms