Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms