Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9Y3F1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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