Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP3Q9Y3E7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.2 ms