Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS5Q9UPZ3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms