Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA1024Q9UPX6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1024Q9UPX6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms