Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms