Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTF2Q9UNY4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms