Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

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Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRQQ9UMZ3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRQQ9UMZ3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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