Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNPO2Q9UMS6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms