Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FBXO4Q9UKT5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FBXO4Q9UKT5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FBXO4Q9UKT5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FBXO4Q9UKT5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FBXO4Q9UKT5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FBXO4Q9UKT5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FBXO4Q9UKT5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FBXO4Q9UKT5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FBXO4Q9UKT5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FBXO4Q9UKT5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FBXO4Q9UKT5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FBXO4Q9UKT5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms