Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms