Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXD3Q9UJU5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms