Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDM5BQ9UGL1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms