Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP2Q9UDT6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms