Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP35Q9P2H5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
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