Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
HMG20BQ9P0W2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20BQ9P0W2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms