Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHMP5Q9NZZ3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms