Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MIS18AQ9NYP9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MIS18AQ9NYP9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms