Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DLL3Q9NYJ7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms