Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms