Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKN2AIPQ9NXV6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms