Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DNAJC28Q9NX36 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJC28Q9NX36 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms