Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXD4L1Q9NU39 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms