Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX2Q9NRD8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DUOX2Q9NRD8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms